基于转录组学和蛋白质组学的高海拔肺动脉高压大鼠模型的最初靶点

冠状动脉高压（PH）是指静息时平均冠状动脉压≥25 mmHg。 它根据心脏动力精研特征、患病必要和组织学精研分成五类。 第三类寒冷冠状动脉高压（HAPH）是由于在寒冷肺部周边环境中的肺换气量代偿性减少和肺消化道血管收缩造成了的，致使高原东部心肌病。 临床疼痛之外机动力发烧、痉挛和疲倦。 HAPH 意味著体现了未能充分利用寒冷，并诱发不明了的组织学生理必要。 据估计有 1.4 亿人生活在沟谷 2,500 米以上的东部，每年有超过 4,000 万人访问这些寒冷东部。 肺部致使器官基因组解读著者再次发生相似之处变化时； 这都有长期居住于在寒冷东部的邻近地区及其后代的变异充分利用性变化时中的得知的。HAPH 的病患仍在系统性中的。应建议患儿转至高于沟谷东部，碳疗直接。本品病患的系统性局限一些随机测试。 HAPH 的组织学与其他子类的 PH 相似，因此很多人考虑对 PAH 直接的本品确实对 HAPH 直接。

然而，所有这些特异性本品都在HAPH中的的直接性和必要亦然不明了。为了解决这个疑问，我们旨在系统性肺部所关乎的化时学键必要，领域于豚鼠 HAPH 静态，并领域综合各种子类精研新方法。 在此更进一步中的，我们旨在系统性几种特异性本品和复碳的起到，以确认寒冷造成了的肺部的潜在新病患抗肿瘤。 特别是，我们系统性了特异性本品如何严重影响器官中间的相似之处基因组和氨基酸解读。

系统性设计：

将豚鼠摆在 10% O2（肺部）室中的 3 周以转化时成 PH。对照豚鼠（C 组）在整个实验者中的都处于常碳周边环境下，并在病患期间（即从第 21 天开始）用核酸透过病患。 3时为，其余豚鼠随机分成六组；一个大被斩首（第 21 天）以检验心肺机能。其余 5 组用特异性本品或复碳病患，从第 21 天到第 35 天斩首。慢性肺部，核酸处理（M）；慢性肺部，司来帕格病患；慢性肺部，布洛克替坦病患；慢性肺部，riociguat 病患；慢性肺部、复碳 (RE)。

RNA组系统性：

提取总 RNA，并通过领域于 Arraystar rRNA Removal Kit 去除 rRNA 来非金属 mRNA 和非解码 RNA。 mRNA 和非解码 RNA 被影片化时悬浮液分解成预告影片（~200-500 nt）。以预告影片为模板，利用随机六聚体引物多肽第一双链cDNA。在第二双链多肽更进一步中的，dTTP 被 dUTP 引入。 然后自组洗脱悬浮液以通过末端修复和添加腺嘌呤来氢化时和分离出来预告影片。 预告影片被氢化时并与接头通往； 领域于SAM-N-糖基化时蛋白质消化时第二条双链。 琼脂糖电子衍射后，同样合适的影片作为模板透过PCR为了将。 领域于 Agilent 2100 海洋生物系统性仪和 ABI StepOnePlus 实时 PCR 一个系统样品库透过定量和质量检验。 该文库领域于 Illumina HiSeq 2000 系统透过化时学多肽。

LC-MS/MS 系统性

在通往到 Easy-nLC 1000 液相色著者系统的Q Exactive HF 质著者仪上系统性样品。将干燥的肽样品再度溶解在盐酸 A（0.1% 硫酸硫酸）中的并载入到捉到集柱中的领域于盐酸 A 的最大压力为 280 bar，然后在制做的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的梯度透过分离出来流动相 B（乙腈和 0.1% 硫酸），流速为 600 nl/min，持续 150 分钟。 QE HF 的 MS 系统性是在 3e6 离子的自动增益控制目标下透过一次全显像，然后透过多达 30 次与信息涉及的 MS/MS 显像具备更高能量的冲撞解离，在 Orbitrap 中的检测到（R = 15,000 在 200 m/z）。

系统性结果：

基于RNA-seq信息的共解读网络平台的机能非金属系统性和枢纽化时学键鉴定。

基于氨基酸信息的共解读网络平台的机能非金属系统性和枢纽化时学键鉴定。

RNA-seq 和免疫精研揭示了对三种本品的加成中间的超强涉及性，具备几乎相同的敏感度。GO 非金属看出相似之处解读的基因组之外自组代谢抑制、RNA和翻译的基因组。

司来帕格、布洛克替坦和复碳可更佳 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被鉴定出来，通过各种子类精研择优，作为自组HAPH的决定性基因组。这些找到为 HAPH 的特异性本品必要提供了最初观念。

系统性事实：

Selexipag、macitentan 和复碳显着消退了豚鼠 HAPH 静态，而 riociguat 的起到较弱。 相似之处解读的基因组自组代谢抑制、RNA和翻译。 某些氨基酸受到 HAPH 和病患的严重影响。 我们领域于各种子类精研新方法择优了决定性基因组 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些找到意味著有助于更多地了解肺部所关乎的化时学键必要，并意味著提供最初病患抗肿瘤。

文献引自：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.